Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDB1Q16531 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
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