Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK4Q16099 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK4Q16099 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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