Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms