Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC1A5Q15758 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.1 ms