Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAM1Q15629 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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