Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms