Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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