Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF1Q15361 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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