Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX17Q15036 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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