Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD4Q14839 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHD4Q14839 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHD4Q14839 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.56■■■□□ 2
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CHD4Q14839 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHD4Q14839 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHD4Q14839 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHD4Q14839 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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CHD4Q14839 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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CHD4Q14839 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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CHD4Q14839 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
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CHD4Q14839 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHD4Q14839 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHD4Q14839 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHD4Q14839 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHD4Q14839 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHD4Q14839 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHD4Q14839 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHD4Q14839 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHD4Q14839 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHD4Q14839 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHD4Q14839 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHD4Q14839 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHD4Q14839 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHD4Q14839 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CHD4Q14839 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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