Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
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