Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCINQ13939 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCINQ13939 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCINQ13939 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCINQ13939 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCINQ13939 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCINQ13939 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCINQ13939 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCINQ13939 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCINQ13939 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCINQ13939 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCINQ13939 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCINQ13939 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCINQ13939 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCINQ13939 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCINQ13939 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCINQ13939 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCINQ13939 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCINQ13939 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCINQ13939 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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