Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDX39BQ13838 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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DDX39BQ13838 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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DDX39BQ13838 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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DDX39BQ13838 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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DDX39BQ13838 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX39BQ13838 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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