Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALCAMQ13740 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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