Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR1Q13613 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
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