Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCIRG1Q13488 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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