Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B2Q13435 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
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