Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN4PQ13434 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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