Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms