Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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