Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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