Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN3Q13286 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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