Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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