Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
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