Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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