Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRN3Q13033 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRN3Q13033 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRN3Q13033 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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