Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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RAB40BQ12829 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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RAB40BQ12829 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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RAB40BQ12829 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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RAB40BQ12829 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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