Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNMA1Q12791 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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