Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 GZF3YJL110C 1656 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 PXA1YPL147W 2613 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 URK1YNR012W 1506 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 RPL13AYDL082W 600 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 SCEIQ0160 708 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 PPX1YHR201C 1194 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 ARC15YIL062C 465 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YKL202WYKL202W 582 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YNL013CYNL013C 378 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 FMP41YNL168C 780 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YNR062CYNR062C 984 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 WRS1YOL097C 1299 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 PFK27YOL136C 1194 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 HUT1YPL244C 1020 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 snR37snR37 386 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 RKM2YDR198C 1440 nt4.89□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 ALG2YGL065C 1512 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 ALD3YMR169C 1521 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 ALD2YMR170C 1521 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 RIM15YFL033C 5313 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 DAL81YIR023W 2913 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 RUB1YDR139C 234 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 RPN12YFR052W 825 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 SCM4YGR049W 564 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 EFG1YGR271C-A 702 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 BAT2YJR148W 1131 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 BUD28YLR062C 378 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 ELO3YLR372W 1038 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 TRS33YOR115C 807 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 LEU1YGL009C 2340 nt4.88□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 STE20YHL007C 2820 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 MCH4YOL119C 1506 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 VID30YGL227W 2877 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 CTS1YLR286C 1689 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 CRD1YDL142C 852 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 NUS1YDL193W 1128 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 RRP45YDR280W 918 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YER084WYER084W 387 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 TYW3YGL050W 822 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YGL132WYGL132W 336 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 COS12YGL263W 1143 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 BUB3YOR026W 1026 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 CUE5YOR042W 1236 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 DCI1YOR180C 816 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YOR238WYOR238W 912 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 CIN2YPL241C 807 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 VPS38YLR360W 1320 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 SEC9YGR009C 1956 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YIL001WYIL001W 1542 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 ADE4YMR300C 1533 nt4.87□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 ADE6YGR061C 4077 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YDR203WYDR203W 318 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 RNA15YGL044C 891 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 EMC4YGL231C 573 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 NAT2YGR147C 867 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YIL163CYIL163C 354 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YLR125WYLR125W 411 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YMR085WYMR085W 1299 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 MRM1YOR201C 1239 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 OXR1YPL196W 822 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 ZUO1YGR285C 1302 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 IOC4YMR044W 1428 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 GAT2YMR136W 1683 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 NOC4YPR144C 1659 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 TPS3YMR261C 3165 nt4.86□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 HIR2YOR038C 2628 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 snR56snR56 88 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 GRX3YDR098C 858 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 LSM4YER112W 564 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YGL138CYGL138C 1038 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 CAX4YGR036C 720 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 NIT2YJL126W 924 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 KTI12YKL110C 942 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 HMX1YLR205C 954 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 DLT1YMR126C 1029 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 CUE2YKL090W 1332 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 SOF1YLL011W 1470 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YGL176CYGL176C 1665 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 SSA2YLL024C 1920 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 IKS1YJL057C 2004 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 TYW1YPL207W 2433 nt4.85□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 GAL4YPL248C 2646 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YTA6YPL074W 2265 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 MIH1YMR036C 1665 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 PUS1YPL212C 1635 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 PRR1YKL116C 1557 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 PAL1YDR348C 1500 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 THP1YOL072W 1368 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 GLT1YDL171C 6438 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 COBQ0105 1158 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YGR064WYGR064W 369 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 YGR115CYGR115C 780 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 RPL27AYHR010W 411 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 VMA22YHR060W 546 nt4.84□□□□□ -1.63
HAL9Q12180 CAP2YIL034C 864 nt4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms