Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC15Q0P6D6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC15Q0P6D6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms