Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms