Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GOLGA3Q08378 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GOLGA3Q08378 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms