Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDR1Q08345 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDR1Q08345 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDR1Q08345 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DDR1Q08345 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DDR1Q08345 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDR1Q08345 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDR1Q08345 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDR1Q08345 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDR1Q08345 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDR1Q08345 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDR1Q08345 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DDR1Q08345 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms