Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 LSO1YJR005C-A 282 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 NMA1YLR328W 1206 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 TDA5YLR426W 981 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 POC4YPL144W 447 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YBR292CYBR292C 372 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 MIH1YMR036C 1665 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ARX1YDR101C 1782 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 HSE1YHL002W 1359 nt4.02□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RRN11YML043C 1524 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 snR7-LsnR7-L 214 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RDI1YDL135C 609 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YDR274CYDR274C 372 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 CYC1YJR048W 330 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ISA1YLL027W 753 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RFU1YLR073C 603 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 MRPS17YMR188C 714 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 REX4YOL080C 870 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 HAT1YPL001W 1125 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RPG1YBR079C 2895 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 Q0255Q0255 1419 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 GAS4YOL132W 1416 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 TDA3YHR009C 1572 nt4.01□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 PUF2YPR042C 3228 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YCR023CYCR023C 1836 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 MEF2YJL102W 2460 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 HIS4YCL030C 2400 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YCL076WYCL076W 744 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YDR056CYDR056C 618 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 SHU2YDR078C 672 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 CMC1YKL137W 336 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 UBI4YLL039C 1146 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 PER33YLR064W 822 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YAR030CYAR030C 342 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 MRPL39YML009C 213 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 CUZ1YNL155W 825 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 UMP1YBR173C 447 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RPS9BYBR189W 588 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RRP7YCL031C 894 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 HOM3YER052C 1584 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 GZF3YJL110C 1656 nt4□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 FAS2YPL231W 5664 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ATM1YMR301C 2073 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 PEX30YLR324W 1572 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 PBI1YPL272C 1554 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ARF2YDL137W 546 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YPR1YDR368W 939 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YJL028WYJL028W 336 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RIF2YLR453C 1188 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YOL107WYOL107W 1029 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YOR097CYOR097C 528 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YOR338WYOR338W 1092 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ARA1YBR149W 1035 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 SLS1YLR139C 1932 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YSH1YLR277C 2340 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 TYW1YPL207W 2433 nt3.99□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 CBF5YLR175W 1452 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YKR015CYKR015C 1707 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ADP1YCR011C 3150 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 BRE4YDL231C 3378 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 MAK11YKL021C 1407 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 CPR1YDR155C 489 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ISC10YER180C 804 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YGL177WYGL177W 348 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 COA3YJL062W-A 258 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 SEC72YLR292C 582 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YIF1YNL263C 945 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 PLP2YOR281C 861 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 SUA7YPR086W 1038 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 REI1YBR267W 1182 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ECM18YDR125C 1362 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 TOG1YER184C 2385 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ALG1YBR110W 1350 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 SWI3YJL176C 2478 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 PDR5YOR153W 4536 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 TRS85YDR108W 2097 nt3.98□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 PMT4YJR143C 2289 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 PRM1YNL279W 1986 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YDL027CYDL027C 1263 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 LPP1YDR503C 825 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 DCS1YLR270W 1053 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RPS1BYML063W 768 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RNA1YMR235C 1224 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 ATG8YBL078C 354 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 TAZ1YPR140W 1146 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 RPN4YDL020C 1596 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 GAD1YMR250W 1758 nt3.97□□□□□ -1.77
SSK1Q07084 DCV1YFR012W 609 nt3.96□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 TYW3YGL050W 822 nt3.96□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 BUD13YGL174W 801 nt3.96□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 FYV6YNL133C 522 nt3.96□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 UFE1YOR075W 1041 nt3.96□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YPL025CYPL025C 558 nt3.96□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YPL077CYPL077C 723 nt3.96□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YND1YER005W 1893 nt3.96□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 SAD1YFR005C 1347 nt3.95□□□□□ -1.78
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