Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 ECM23YPL021W 564 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YPR123CYPR123C 435 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 GUD1YDL238C 1470 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 SEO1YAL067C 1782 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 GIP1YBR045C 1920 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 UGA2YBR006W 1494 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 RIO1YOR119C 1455 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 MPH2YDL247W 1830 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 MSW1YDR268W 1140 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 DAL3YIR032C 588 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YJR087WYJR087W 351 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 VPH2YKL119C 648 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 RPC37YKR025W 849 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 UPS2YLR168C 693 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 SWM2YNR004W 441 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 PDX3YBR035C 687 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 RFC5YBR087W 1065 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 ACS1YAL054C 2142 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YOL036WYOL036W 2286 nt6.05□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YML020WYML020W 1995 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 WHI2YOR043W 1461 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 MMT2YPL224C 1455 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 UBC13YDR092W 462 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 THI4YGR144W 981 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YHR213WYHR213W 597 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YIL161WYIL161W 708 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 JLP1YLL057C 1239 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YAR062WYAR062W 597 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 MRPL44YMR225C 297 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 PRX1YBL064C 786 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt6.04□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 DSE1YER124C 1722 nt6.03□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YAR053WYAR053W 297 nt6.03□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 CAF20YOR276W 486 nt6.03□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 CSM4YPL200W 471 nt6.03□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 CBP3YPL215W 1008 nt6.03□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 CNE1YAL058W 1509 nt6.03□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 MOT2YER068W 1764 nt6.03□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 RTK1YDL025C 1863 nt6.02□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 RAD30YDR419W 1899 nt6.02□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 SLF1YDR515W 1344 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 RPL12AYEL054C 498 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 IES5YER092W 378 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YER181CYER181C 324 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YGR018CYGR018C 330 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 BCY1YIL033C 1251 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YLR101CYLR101C 396 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 SST2YLR452C 2097 nt6.02□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 PMS1YNL082W 2622 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MNN5YJL186W 1761 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 UBC8YEL012W 657 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MIG2YGL209W 1149 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 CDC12YHR107C 1224 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YML018CYML018C 1182 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YNL035CYNL035C 1170 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YBR051WYBR051W 351 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 BOP2YLR267W 1713 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 TDA3YHR009C 1572 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 SIS2YKR072C 1689 nt6.01□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 KKQ8YKL168C 2175 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YDL144CYDL144C 1071 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 ERD1YDR414C 1089 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 FUR1YHR128W 651 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YKE4YIL023C 1041 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MRS1YIR021W 1092 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 ACP1YKL192C 378 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MOH1YBL049W 417 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 STB5YHR178W 2232 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 PRI2YKL045W 1587 nt6□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 FAR10YLR238W 1437 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MAK31YCR020C-A 267 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YET3YDL072C 612 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YPT35YHR105W 645 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 ASG7YJL170C 630 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 FUN19YAL034C 1242 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 PIR3YKL163W 978 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MRPL40YPL173W 894 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 RMD9YGL107C 1941 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 EMP46YLR080W 1335 nt5.99□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 HCA4YJL033W 2313 nt5.98□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 OCT1YKL134C 2319 nt5.98□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 CCZ1YBR131W 2115 nt5.98□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 RRP4YHR069C 1080 nt5.98□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt5.98□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 YMR295CYMR295C 594 nt5.98□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MRPL10YNL284C 969 nt5.98□□□□□ -1.45
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