Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN1Q05586 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms