Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms