Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYBPC1Q00872 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms