Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEP78395 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms