Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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