Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms