Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTBP60709 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTBP60709 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTBP60709 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTBP60709 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTBP60709 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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