Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP4P57796 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP4P57796 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP4P57796 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP4P57796 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP4P57796 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP4P57796 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP4P57796 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP4P57796 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP4P57796 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP4P57796 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP4P57796 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP4P57796 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP4P57796 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP4P57796 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP4P57796 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP4P57796 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP4P57796 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP4P57796 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP4P57796 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP4P57796 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP4P57796 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP4P57796 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP4P57796 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP4P57796 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP4P57796 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP4P57796 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP4P57796 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP4P57796 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP4P57796 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP4P57796 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP4P57796 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP4P57796 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP4P57796 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP4P57796 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP4P57796 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP4P57796 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP4P57796 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP4P57796 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP4P57796 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP4P57796 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP4P57796 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP4P57796 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP4P57796 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP4P57796 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP4P57796 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP4P57796 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP4P57796 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP4P57796 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP4P57796 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP4P57796 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP4P57796 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP4P57796 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP4P57796 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP4P57796 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP4P57796 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP4P57796 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP4P57796 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP4P57796 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP4P57796 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP4P57796 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP4P57796 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP4P57796 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP4P57796 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP4P57796 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP4P57796 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP4P57796 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP4P57796 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP4P57796 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP4P57796 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP4P57796 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP4P57796 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP4P57796 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP4P57796 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP4P57796 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP4P57796 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP4P57796 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms