Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSDMDP57764 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms