Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBASH3AP57075 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms