Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSCP56915 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSCP56915 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSCP56915 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GSCP56915 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GSCP56915 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSCP56915 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSCP56915 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSCP56915 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSCP56915 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSCP56915 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSCP56915 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSCP56915 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSCP56915 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSCP56915 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSCP56915 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GSCP56915 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSCP56915 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSCP56915 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSCP56915 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GSCP56915 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GSCP56915 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSCP56915 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSCP56915 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSCP56915 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms