Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME5P56597 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME5P56597 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME5P56597 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME5P56597 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME5P56597 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME5P56597 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME5P56597 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME5P56597 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME5P56597 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME5P56597 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME5P56597 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME5P56597 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME5P56597 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME5P56597 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME5P56597 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME5P56597 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME5P56597 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME5P56597 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME5P56597 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME5P56597 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.5 ms