Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP1P56182 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP1P56182 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1P56182 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1P56182 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP1P56182 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP1P56182 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP1P56182 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP1P56182 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP1P56182 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP1P56182 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1P56182 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP1P56182 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1P56182 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1P56182 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1P56182 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1P56182 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1P56182 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1P56182 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1P56182 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1P56182 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1P56182 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1P56182 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1P56182 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1P56182 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1P56182 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1P56182 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1P56182 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1P56182 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1P56182 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms