Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX1P55347 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms