Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH13P55290 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH13P55290 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH13P55290 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH13P55290 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH13P55290 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH13P55290 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH13P55290 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH13P55290 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH13P55290 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH13P55290 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH13P55290 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH13P55290 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH13P55290 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH13P55290 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH13P55290 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH13P55290 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH13P55290 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH13P55290 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH13P55290 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH13P55290 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH13P55290 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH13P55290 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH13P55290 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH13P55290 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH13P55290 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH13P55290 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH13P55290 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH13P55290 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH13P55290 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH13P55290 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms